Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim58Q5NCC9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms