Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zmat1Q3V0C1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms