Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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BB287469Q3UT53 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
BB287469Q3UT53 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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