Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gm28047Q3US59 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm28047Q3US59 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms