Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Acsf3Q3URE1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms