Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Nkx6-3Q3UHX8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Nkx6-3Q3UHX8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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