Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Puf60Q3UEB3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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