Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm18190-201ENSMUST00000174801 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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