Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c3Q3TMP1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c3Q3TMP1 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms