Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trappc13Q3TIR1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms