Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Prr27Q3SYJ2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Prr27Q3SYJ2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms