Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hddc2Q3SXD3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms