Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccbe1Q3MI99 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Ccbe1Q3MI99 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccbe1Q3MI99 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccbe1Q3MI99 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccbe1Q3MI99 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccbe1Q3MI99 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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