Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim71Q1PSW8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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