Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ptcd3Q14C51 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms