Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Spatc1Q148B6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spatc1Q148B6 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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