Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnnm1Q0GA42 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms