Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
MitfQ08874 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms