Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tff1Q08423 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tff1Q08423 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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