Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Siah1bQ06985 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Siah1bQ06985 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms