Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Apoc2Q05020 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms