Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp1Q03401 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms