Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Msx2Q03358 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms