Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
GscQ02591 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
GscQ02591 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GscQ02591 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
GscQ02591 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
GscQ02591 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms