Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VcpQ01853 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms