Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nme2Q01768 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nme2Q01768 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms