Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PrcdQ00LT2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms