Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F8a1Q00558 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
F8a1Q00558 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms