Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SgcaP82350 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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