Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx3P81067 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms