Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Irx2P81066 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms