Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxd13P70217 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Hoxd13P70217 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hoxd13P70217 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd13P70217 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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