Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ufm1P61961 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms