Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smg6P61406 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smg6P61406 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg6P61406 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms