Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dpf3P58269 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Dpf3P58269 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Dpf3P58269 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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