Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Irf5P56477 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Irf5P56477 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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