Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CartptP56388 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CartptP56388 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CartptP56388 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CartptP56388 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms