Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rad23bP54728 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms