Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Efnb1P52795 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms