Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxc13P50207 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms