Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Tmod1P49813 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tmod1P49813 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmod1P49813 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms