Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Epb42P49222 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Epb42P49222 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms