Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Epb41P48193 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Epb41P48193 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Epb41P48193 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms