Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc11P31313 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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