Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Msr1P30204 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Msr1P30204 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms