Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Slc6a9P28571 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms