Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pde6bP23440 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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