Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
PrkchP23298 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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