Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Fcer1aP20489 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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