Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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PrkcaP20444 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PrkcaP20444 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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